MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 44852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015875	GAAA	2	8	3	10	75 %	0 %	25 %	0 %	342162672
2	NC_015875	AAGA	2	8	44	51	75 %	0 %	25 %	0 %	342162672
3	NC_015875	TCA	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162672
4	NC_015875	GAAATG	2	12	142	153	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	342162672
5	NC_015875	AAC	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162672
6	NC_015875	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162672
7	NC_015875	ATG	2	6	206	211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162672
8	NC_015875	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162672
9	NC_015875	AAAAG	2	10	345	354	80 %	0 %	20 %	0 %	342162672
10	NC_015875	GCT	2	6	406	411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162672
11	NC_015875	GGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162672
12	NC_015875	GAAAT	2	10	506	515	60 %	20 %	20 %	0 %	342162672
13	NC_015875	A	6	6	519	524	100 %	0 %	0 %	0 %	342162672
14	NC_015875	A	7	7	616	622	100 %	0 %	0 %	0 %	342162672
15	NC_015875	GAT	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162672
16	NC_015875	A	7	7	675	681	100 %	0 %	0 %	0 %	342162672
17	NC_015875	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162672
18	NC_015875	GAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162672
19	NC_015875	C	7	7	836	842	0 %	0 %	0 %	100 %	342162672
20	NC_015875	A	6	6	999	1004	100 %	0 %	0 %	0 %	342162672
21	NC_015875	TGC	2	6	1029	1034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162672
22	NC_015875	ATA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162672
23	NC_015875	TGG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	342162672
24	NC_015875	CA	3	6	1261	1266	50 %	0 %	0 %	50 %	342162672
25	NC_015875	TGAT	2	8	1301	1308	25 %	50 %	25 %	0 %	342162672
26	NC_015875	AATC	2	8	1337	1344	50 %	25 %	0 %	25 %	342162672
27	NC_015875	TAT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015875	T	6	6	1390	1395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015875	T	6	6	1403	1408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015875	TAT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015875	TAT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015875	ATAA	2	8	1503	1510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015875	TAA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162673
34	NC_015875	ATTT	2	8	1546	1553	25 %	75 %	0 %	0 %	342162673
35	NC_015875	AG	3	6	1576	1581	50 %	0 %	50 %	0 %	342162673
36	NC_015875	A	7	7	1699	1705	100 %	0 %	0 %	0 %	342162673
37	NC_015875	CTT	2	6	1729	1734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162673
38	NC_015875	CTT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162673
39	NC_015875	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162673
40	NC_015875	TGC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162673
41	NC_015875	AG	3	6	1988	1993	50 %	0 %	50 %	0 %	342162673
42	NC_015875	A	6	6	2082	2087	100 %	0 %	0 %	0 %	342162673
43	NC_015875	TGA	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162673
44	NC_015875	GAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162673
45	NC_015875	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162673
46	NC_015875	GTT	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162673
47	NC_015875	GTAAA	2	10	2446	2455	60 %	20 %	20 %	0 %	342162673
48	NC_015875	GAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162673
49	NC_015875	ACTT	2	8	2514	2521	25 %	50 %	0 %	25 %	342162673
50	NC_015875	GATT	2	8	2522	2529	25 %	50 %	25 %	0 %	342162673
51	NC_015875	CAG	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162673
52	NC_015875	TGA	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162673
53	NC_015875	AGT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015875	TGAAA	2	10	2745	2754	60 %	20 %	20 %	0 %	342162674
55	NC_015875	A	6	6	2752	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	342162674
56	NC_015875	A	6	6	2788	2793	100 %	0 %	0 %	0 %	342162674
57	NC_015875	TGT	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162674
58	NC_015875	ATG	2	6	2866	2871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162674
59	NC_015875	TTAG	2	8	2923	2930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015875	TGAAA	2	10	2974	2983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015875	CAG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
62	NC_015875	GCA	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
63	NC_015875	CGA	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
64	NC_015875	AACT	2	8	3157	3164	50 %	25 %	0 %	25 %	342162675
65	NC_015875	CAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162675
66	NC_015875	TGA	3	9	3320	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162675
67	NC_015875	TTC	2	6	3505	3510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162675
68	NC_015875	GAC	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
69	NC_015875	CAAA	2	8	3680	3687	75 %	0 %	0 %	25 %	342162675
70	NC_015875	AGT	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162675
71	NC_015875	GAA	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162675
72	NC_015875	A	6	6	3777	3782	100 %	0 %	0 %	0 %	342162675
73	NC_015875	CTTG	2	8	3848	3855	0 %	50 %	25 %	25 %	342162675
74	NC_015875	ACTT	2	8	3864	3871	25 %	50 %	0 %	25 %	342162675
75	NC_015875	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162675
76	NC_015875	GTA	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162675
77	NC_015875	CTC	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	342162675
78	NC_015875	AGC	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162675
79	NC_015875	AAG	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162675
80	NC_015875	GAA	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162675
81	NC_015875	AT	3	6	4067	4072	50 %	50 %	0 %	0 %	342162675
82	NC_015875	A	6	6	4114	4119	100 %	0 %	0 %	0 %	342162675
83	NC_015875	TAA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015875	A	7	7	4146	4152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015875	AAAT	2	8	4181	4188	75 %	25 %	0 %	0 %	342162676
86	NC_015875	AAACA	2	10	4236	4245	80 %	0 %	0 %	20 %	342162676
87	NC_015875	TTGA	2	8	4262	4269	25 %	50 %	25 %	0 %	342162676
88	NC_015875	A	6	6	4280	4285	100 %	0 %	0 %	0 %	342162676
89	NC_015875	A	6	6	4353	4358	100 %	0 %	0 %	0 %	342162676
90	NC_015875	ATGA	2	8	4385	4392	50 %	25 %	25 %	0 %	342162676
91	NC_015875	TTA	2	6	4423	4428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162676
92	NC_015875	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162676
93	NC_015875	GAT	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162676
94	NC_015875	CAG	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162676
95	NC_015875	TAT	2	6	4540	4545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162676
96	NC_015875	GTT	2	6	4616	4621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162676
97	NC_015875	GAT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162676
98	NC_015875	GAC	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162676
99	NC_015875	ACT	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	342162676
100	NC_015875	A	6	6	4728	4733	100 %	0 %	0 %	0 %	342162676
101	NC_015875	TTA	2	6	4766	4771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162677
102	NC_015875	A	7	7	4798	4804	100 %	0 %	0 %	0 %	342162677
103	NC_015875	TAG	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
104	NC_015875	AAGAT	2	10	4899	4908	60 %	20 %	20 %	0 %	342162677
105	NC_015875	TCT	2	6	4957	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	342162677
106	NC_015875	ATCT	2	8	4963	4970	25 %	50 %	0 %	25 %	342162677
107	NC_015875	A	6	6	5043	5048	100 %	0 %	0 %	0 %	342162677
108	NC_015875	T	6	6	5074	5079	0 %	100 %	0 %	0 %	342162677
109	NC_015875	GCA	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	342162677
110	NC_015875	GATT	2	8	5130	5137	25 %	50 %	25 %	0 %	342162677
111	NC_015875	GAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
112	NC_015875	GAG	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162677
113	NC_015875	T	6	6	5339	5344	0 %	100 %	0 %	0 %	342162677
114	NC_015875	TGA	2	6	5347	5352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
115	NC_015875	GAAA	2	8	5395	5402	75 %	0 %	25 %	0 %	342162677
116	NC_015875	GA	3	6	5446	5451	50 %	0 %	50 %	0 %	342162677
117	NC_015875	GTCA	2	8	5469	5476	25 %	25 %	25 %	25 %	342162677
118	NC_015875	AGA	2	6	5530	5535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
119	NC_015875	A	7	7	5634	5640	100 %	0 %	0 %	0 %	342162677
120	NC_015875	TGA	2	6	5656	5661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
121	NC_015875	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
122	NC_015875	AGA	2	6	5722	5727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
123	NC_015875	A	6	6	5789	5794	100 %	0 %	0 %	0 %	342162677
124	NC_015875	T	6	6	5809	5814	0 %	100 %	0 %	0 %	342162677
125	NC_015875	TCAA	2	8	5895	5902	50 %	25 %	0 %	25 %	342162677
126	NC_015875	T	6	6	5908	5913	0 %	100 %	0 %	0 %	342162677
127	NC_015875	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	342162677
128	NC_015875	A	7	7	5936	5942	100 %	0 %	0 %	0 %	342162677
129	NC_015875	TAT	2	6	5953	5958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	342162677
130	NC_015875	GGA	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	342162677
131	NC_015875	CAA	2	6	6056	6061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	342162677
132	NC_015875	CGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162677
133	NC_015875	AG	3	6	6196	6201	50 %	0 %	50 %	0 %	342162677
134	NC_015875	GTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162677
135	NC_015875	TAAAT	2	10	6421	6430	60 %	40 %	0 %	0 %	342162677
136	NC_015875	ACTCT	2	10	6502	6511	20 %	40 %	0 %	40 %	342162677
137	NC_015875	TGA	2	6	6571	6576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
138	NC_015875	GAT	2	6	6599	6604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
139	NC_015875	GTA	2	6	6612	6617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	342162677
140	NC_015875	AG	3	6	6630	6635	50 %	0 %	50 %	0 %	342162677
141	NC_015875	GTC	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	342162677
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144	NC_015875	A	6	6	6889	6894	100 %	0 %	0 %	0 %	342162677
145	NC_015875	TGT	2	6	6943	6948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162677
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158	NC_015875	AAACG	2	10	7745	7754	60 %	0 %	20 %	20 %	342162677
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251	NC_015875	A	6	6	11716	11721	100 %	0 %	0 %	0 %	342162683
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262	NC_015875	A	6	6	12179	12184	100 %	0 %	0 %	0 %	342162684
263	NC_015875	AAT	2	6	12188	12193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	342162684
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266	NC_015875	T	7	7	12231	12237	0 %	100 %	0 %	0 %	342162684
267	NC_015875	ATTA	2	8	12296	12303	50 %	50 %	0 %	0 %	342162684
268	NC_015875	ACCA	2	8	12354	12361	50 %	0 %	0 %	50 %	342162684
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392	NC_015875	A	8	8	17455	17462	100 %	0 %	0 %	0 %	342162694
393	NC_015875	AG	3	6	17478	17483	50 %	0 %	50 %	0 %	342162694
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398	NC_015875	TAT	2	6	17944	17949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_015875	GTT	2	6	17997	18002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	342162695
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402	NC_015875	A	6	6	18250	18255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_015875	A	6	6	18257	18262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_015875	AC	3	6	18279	18284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
405	NC_015875	GTA	2	6	18290	18295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
406	NC_015875	GTC	2	6	18296	18301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
407	NC_015875	A	7	7	18310	18316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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